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Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems - Couverture souple

 
9781071617694: Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems

Synopsis

1. Current Approaches of Building Mechanistic Pharmacodynamic Drug-Target Binding Models

Jingyi Liang, Vi Ngoc-Nha Tran, Colin Hemez, and Pia Abel zur Wiesch

2. An Extended Model Including Target Turnover, Ligand-Target Complex Kinetics, and Binding Properties to Describe Drug-Receptor Interactions

Lambertus A. Peletier

3. Beyond the Michaelis-Menten: Bayesian Inference for Enzyme Kinetic Analysis

Hyukpyo Hong, Boseung Choi, and Jae Kyoung Kim

4. Multi-Objective Optimization Tuning Framework for Kinetic Parameter Selection and Estimation

Yadira Boada, Jesús Picó, and Alejandro Vignoni

5. Relationship between Dimensionality and Convergence of Optimization Algorithms: A Comparison between Data-Driven Normalization and Scaling Factor-Based Methods Using PEPSSBI

Andrea Degasperi, Lan K. Nguyen, Dirk Fey, and Boris N. Kholodenko

6. Dynamic Optimization Approach to Estimate Kinetic Parameters of Monod-Based Microalgae Growth Models

Siti S. Jamaian, Fathul H. Zulkifli, and Kim S. Ling

7. Automatic Assembly and Calibration of Models of Enzymatic Reactions Based on Ordinary Differential Equations

Jure Stojan, Milan Hodosček, and Dusanka Janezič

8. Data Processing to Probe the Cellular Hydrogen Peroxide Landscape

Fernando Antunes and Paula Brito

9. Computational Methods for Structure-Based Drug Design through Systems Biology

Aman Chandra Kaushik, Shakti Sahi, and Dong-Qing Wei

10. Model Setup and Procedures for Prediction of Enzyme Reaction Kinetics with QM-Only and QM: MM Approaches

Michal Glanowski, Sangita Kachhap, Tomasz Borowski, and Maciej Szaleniec

11. The Role of Ligand Rebinding and Facilitated Dissociation on the Characterization of Dissociation Rates by Surface Plasmon Resonance (SPR) and Benchmarking Performance Metrics

Aykut Erbaş and Fatih Inci

12. Computational Tools for Accurate Binding Free Energy Prediction

Maria M. Reif and Martin Zacharias

13. Computational Alanine Scanning Reveals Common Features of TCR/pMHC Recognition in HLA-DQ8-Associated Celiac Disease

Linqiong Qiu, Jianing Song, and John Z.H. Zhang

14. Umbrella Sampling-Based Method to Compute Ligand-Binding Affinity

Son Tung Ngo and Minh Quan Pham

15. Creating Maps of the Ligand Binding Landscape for Kinetics-Based Drug Discovery

Tom Dixon, Samuel D. Lotz, and Alex Dickson

16. Prediction of Protein-Protein Binding Affinities from Unbound Protein Structures

&nb

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  • ÉditeurHumana
  • Date d'édition2022
  • ISBN 10 1071617699
  • ISBN 13 9781071617694
  • ReliureBroché
  • Langueanglais
  • Nombre de pages392
  • ÉditeurVanhaelen Quentin
  • Coordonnées du fabricantnon disponible

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9781071617663: Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems

Edition présentée

ISBN 10 :  1071617664 ISBN 13 :  9781071617663
Editeur : Springer-Verlag New York Inc., 2021
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Edité par Springer US, 2022
ISBN 10 : 1071617699 ISBN 13 : 9781071617694
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Taschenbuch. Etat : Neu. This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This detailed book provides an overview of various classes of computational techniques, including machine learning techniques, commonly used for evaluating kinetic parameters of biological systems. Focusing on three distinct situations, the volume covers the prediction of the kinetics of enzymatic reactions, the prediction of the kinetics of protein-protein or protein-ligand interactions (binding rates, dissociation rates, binding affinities), and the prediction of relatively large set of kinetic rates of reactions usually found in quantitative models of large biological networks. Written for the highly successful Methods in Molecular Biology series, chapters include the kind of expert implementation advice that leads to successful results.Authoritative and practical, Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems will be of great interest for researchers working through the challenge of identifying the best type of algorithm and who would like to use or develop a computational method for the estimation of kinetic parameters. 392 pp. Englisch. N° de réf. du vendeur 9781071617694

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Taschenbuch. Etat : Neu. Druck auf Anfrage Neuware - Printed after ordering - This detailed book provides an overview of various classes of computational techniques, including machine learning techniques, commonly used for evaluating kinetic parameters of biological systems. Focusing on three distinct situations, the volume covers the prediction of the kinetics of enzymatic reactions, the prediction of the kinetics of protein-protein or protein-ligand interactions (binding rates, dissociation rates, binding affinities), and the prediction of relatively large set of kinetic rates of reactions usually found in quantitative models of large biological networks. Written for the highly successful Methods in Molecular Biology series, chapters include the kind of expert implementation advice that leads to successful results.Authoritative and practical, Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems will be of great interest for researchers working through the challenge of identifying the best type of algorithm and who would like to use or develop a computational method for the estimation of kinetic parameters. N° de réf. du vendeur 9781071617694

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