Synopsis
Eine Lösung für das Problem der Proteinfaltung entzieht sich Forschern seit mehr als 30 Jahren. Die Einsätze sind hoch. Eine solche Lösung wird 40.000 weitere Tertiärstrukturen für eine sofortige Untersuchung zur Verfügung stellen, indem die DNA-Sequenzinformationen in den Sequenzdatenbanken in dreidimensionale Proteinstrukturen übersetzt werden. Diese Übersetzung wird für die Analyse der Ergebnisse aus dem Human Genome Project, de novo Proteindesign und vielen anderen Bereichen der biotechnologischen Forschung unverzichtbar sein. Schließlich sollte eine eingehende Untersuchung der Regeln der Proteinfaltung wichtige Hinweise auf den Proteinfaltungsprozess liefern. Die Suche nach diesen Regeln ist daher ein wichtiges Ziel der theoretischen Molekularbiologie. Sowohl experimentelle als auch theoretische ap- Proaches wurden bei der Suche nach einer Lösung verwendet, mit vielen vielversprechenden Ergebnissen, aber ohne allgemeine Lösung. In den letzten Jahren gab es einen exponentiellen Anstieg der Leistung von Computern. Dies hat einen unglaublichen Ausbruch theoretischer Ansätze zur Lösung des Proteinfaltungsproblems ausgelöst, der von molekulardynamikbasierten Studien von Proteinen in Lösung bis zur tatsächlichen Vorhersage von Proteinstrukturen aus den ersten Prinzipien reicht. Dieser Band versucht, einen prägnanten Überblick über diese Fortschritte zu geben. Adrian Roitberg und Ron Elber beschreiben den lokal verbesserten Sampling/simulierten Annealing-Konformationssuchalgorithmus (Kapitel 1), der potenziell für die schnelle Konformationssuche größerer molekularer Systeme nützlich ist.
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