Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems
Langue : anglais
Edité par Springer Dez 2021, 2021
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- Neuf

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This item is printed on demand - Print on Demand Titel. Neuware -Current Approaches of Building Mechanistic Pharmacodynamic Drug-Target Binding Models.- An Extended Model Including Target Turnover, Ligand-Target Complex Kinetics, and Binding Properties to Describe Drug-Receptor Interactions.- Beyond the Michaelis-Menten: Bayesian Inference for Enzyme Kinetic Analysis.- Multi-Objective Optimization Tuning Framework for Kinetic Parameter Selection and Estimation.- Relationship between Dimensionality and Convergence of Optimization Algorithms: A Comparison between Data-Driven Normalization and Scaling Factor-Based Methods Using PEPSSBI.- Dynamic Optimization Approach to Estimate Kinetic Parameters of Monod-Based Microalgae Growth Models.- Automatic Assembly and Calibration of Models of Enzymatic Reactions Based on Ordinary Differential Equations.- Data Processing to Probe the Cellular Hydrogen Peroxide Landscape.- Computational Methods for Structure-Based Drug Design through Systems Biology.- Model Setup and Procedures for Prediction of Enzyme Reaction Kinetics with QM-Only and QM:MM Approaches.- The Role of Ligand Rebinding and Facilitated Dissociation on the Characterization of Dissociation Rates by Surface Plasmon Resonance (SPR) and Benchmarking Performance Metrics.- Computational Tools for Accurate Binding Free Energy Prediction.- Computational Alanine Scanning Reveals Common Features of TCR/pMHC Recognition in HLA-DQ8-Associated Celiac Disease.- Umbrella Sampling-Based Method to Compute Ligand-Binding Affinity.- Creating Maps of the Ligand Binding Landscape for Kinetics-Based Drug Discovery.- Prediction of Protein-Protein Binding Affinities from Unbound Protein Structures.- Parameter Optimization for Ion Channel Models: Integrating New Data with Known Channel Properties.Libri GmbH, Europaallee 1, 36244 Bad Hersfeld 392 pp. Englisch.…
N° de réf. du vendeur 9781071617663
- Titre
- Computational Methods for Estimating the Kinetic Parameters of Biological Systems
- Auteur
- Quentin Vanhaelen
- Éditeur
- Springer Dez 2021
- Année de publication
- 2021
- État de l'article
- Neu
- Reliure
- Buch
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 1071617664
- ISBN à 13 chiffres
- 9781071617663
- Poids de l'article
- 932 grammes
- Dimensions
- 260x183x27 mm
- Série
- Livre 102 sur 382: Methods in Molecular Biology
1. Current Approaches of Building Mechanistic Pharmacodynamic Drug-Target Binding Models
Jingyi Liang, Vi Ngoc-Nha Tran, Colin Hemez, and Pia Abel zur Wiesch
2. An Extended Model Including Target Turnover, Ligand-Target Complex Kinetics, and Binding Properties to Describe Drug-Receptor Interactions
Lambertus A. Peletier
3. Beyond the Michaelis-Menten: Bayesian Inference for Enzyme Kinetic Analysis
Hyukpyo Hong, Boseung Choi, and Jae Kyoung Kim
4. Multi-Objective Optimization Tuning Framework for Kinetic Parameter Selection and Estimation
Yadira Boada, Jesús Picó, and Alejandro Vignoni
5. Relationship between Dimensionality and Convergence of Optimization Algorithms: A Comparison between Data-Driven Normalization and Scaling Factor-Based Methods Using PEPSSBI
Andrea Degasperi, Lan K. Nguyen, Dirk Fey, and Boris N. Kholodenko6. Dynamic Optimization Approach to Estimate Kinetic Parameters of Monod-Based Microalgae Growth Models
Siti S. Jamaian, Fathul H. Zulkifli, and Kim S. Ling
7. Automatic Assembly and Calibration of Models of Enzymatic Reactions Based on Ordinary Differential Equations
Jure Stojan, Milan Hodosček, and Dusanka Janezič
8. Data Processing to Probe the Cellular Hydrogen Peroxide Landscape
Fernando Antunes and Paula Brito
9. Computational Methods for Structure-Based Drug Design through Systems Biology
Aman Chandra Kaushik, Shakti Sahi, and Dong-Qing Wei
10. Model Setup and Procedures for Prediction of Enzyme Reaction Kinetics with QM-Only and QM: MM Approaches
Michal Glanowski, Sangita Kachhap, Tomasz Borowski, and Maciej Szaleniec
11. The Role of Ligand Rebinding and Facilitated Dissociation on the Characterization of Dissociation Rates by Surface Plasmon Resonance (SPR) and Benchmarking Performance Metrics
Aykut Erbaş and Fatih Inci
12. Computational Tools for Accurate Binding Free Energy Prediction
Maria M. Reif and Martin Zacharias
13. Computational Alanine Scanning Reveals Common Features of TCR/pMHC Recognition in HLA-DQ8-Associated Celiac Disease
Linqiong Qiu, Jianing Song, and John Z.H. Zhang
14. Umbrella Sampling-Based Method to Compute Ligand-Binding Affinity
Son Tung Ngo and Minh Quan Pham
15. Creating Maps of the Ligand Binding Landscape for Kinetics-Based Drug Discovery
Tom Dixon, Samuel D. Lotz, and Alex Dickson
16. Prediction of Protein-Protein Binding Affinities from Unbound Protein Structures
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Alternative Streitbeilegung:
Die Europäische Kommission stellt eine Plattform für die außergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter http://ec.europa.eu/odr.
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