Computational Methods for Single-Cell Data Analysis
Langue : anglais
Edité par Humana Feb 2019, 2019
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- Neuf
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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This detailed book provides state-of-art computational approaches to further explore the exciting opportunities presented by single-cell technologies. Chapters each detail a computational toolbox aimed to overcome a specific challenge in single-cell analysis, such as data normalization, rare cell-type identification, and spatial transcriptomics analysis, all with a focus on hands-on implementation of computational methods for analyzing experimental data. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.Authoritative and cutting-edge, Computational Methods for Single-Cell Data Analysis aims to cover a wide range of tasks and serves as a vital handbook for single-cell data analysis. 284 pp. Englisch.…
N° de réf. du vendeur 9781493990566
- Titre
- Computational Methods for Single-Cell Data Analysis
- Auteur
- Guo-Cheng Yuan
- Éditeur
- Humana Feb 2019
- Année de publication
- 2019
- État de l'article
- Neu
- Reliure
- Buch
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 149399056X
- ISBN à 13 chiffres
- 9781493990566
- Poids de l'article
- 736 grammes
- Dimensions
- 260x183x21 mm
2. Normalization for Single-cell RNA-seq Data Analysis
Rhonda Bacher
3. Analysis of Technical and Biological Variability in Single-cell RNA Sequencing
Beomseok Kim, Eunmin Lee, and Jong Kyoung Kim
4. Identification of Cell Types from Single-cell Transcriptomic Data
Karthik Shekhar and Vilas Menon
5. Rare Cell Type Detection
Lan Jiang
6. scMCA- A Tool Defines Cell Types in Mouse Based on Single-cell Digital Expression
Huiyu Sun, Yincong Zhou, Lijiang Fei, Haide Chen, and Guoji Guo
7. Differential Pathway Analysis
Jean Fan
8. Differential Pathway Analysis
Jean Fan
9. Estimating Differentiation Potency of Single Cells using Single Cell Entropy (SCENT)
Weiyan Chen and Andrew E Teschendorff10. Inference of Gene Co-expression Networks from Single-Cell RNA-sequencing Data
Alicia T. Lamere and Jun Li
11. Single-cell Allele-specific Gene Expression Analysis
Meichen Dong andYuchao Jiang
12. Using BRIE to Detect and Analyse Splicing Isoforms in scRNA-seq Data
Yuanhua Huang and Guido Sanguinetti
13. Preprocessing and Computational Analysis of Single-cell Epigenomic Datasets
Caleb Lareau, Divy Kangeyan, and Martin J. Aryee
14. Experimental and Computational Approaches for Single-cell Enhancer Perturbation Assay
Shiqi Xie and Gary C. Hon15. Antigen Receptor Sequence Reconstruction and Clonality Inference from scRNA-seq Data
Ida Lindeman and Michael J.T. Stubbington16. A Hidden Markov Random Field Model for Detecting Domain Organizations from Spatial Transcriptomic Data
Qian Zhu« Synopsis » peut appartenir à une autre édition de cet ouvrage.
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