Exploring the Referentially-compressed Genomes : Advantages and Challenges

Langue : anglais

Edité par LAP LAMBERT Academic Publishing, 2015

3659791121 / 9783659791123

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nach der Bestellung gedruckt Neuware - Printed after ordering - Modern genome sequencing technologies produce enormous amount of data daily. Biologists in turn are keen to precisely explore this genomic data in order to discover effective patterns that have a real impact on the function and evolution of living creatures. Therefore, it becomes very critical to professionally store this data in order to efficiently explore it in a frequent manner. Reference-based Compression algorithms (RbCs) efficiently compress the sequenced genomes by mainly storing their differences with respect to a reference genome. Therefore, RbCs give amazing compression ratios compared to the traditional compression algorithms. However, in order to explore a compressed genome, it has to be totally decompressed, wasting both time and storage. By avoiding their complete decompression, the compressed genomes can be explored by performing partial decompressions at specific regions, gaining a significant reduction in runtime, memory, and storage consumption. Moreover, the complete decompression of a compressed genome can be performed more efficiently through successive partial decompressions.…

N° de réf. du vendeur 9783659791123

Titre
Exploring the Referentially-compressed Genomes : Advantages and Challenges
Auteur
Mohammad Nassef
Éditeur
LAP LAMBERT Academic Publishing
Année de publication
2015
État de l'article
Neu
Reliure
Taschenbuch
Langue
anglais
ISBN à 10 chiffres
3659791121
ISBN à 13 chiffres
9783659791123
Poids de l'article
179 grammes
Dimensions
220x150x8 mm

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