Metagenomic Data Analysis

Langue : anglais

Edité par Humana Jun 2023, 2023

1071630741 / 9781071630747

Série : Livre 272 sur 382 - Methods in Molecular Biology

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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This volume describes different sequencing methods, pipelines and tools for metagenome data analyses. Chapters guide readers through quality control of raw sequence data, metagenomics databases for bacterial annotations suchGreengenes, SILVA, RDP and GTDB, guide to 16S rRNA microbiome analysis and pipelines such asmothur, DADA2,QIIME2, whole genome shotgun metagenomics data analyses pipeline using MEGAN and DIAMOND, web service such as PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist and MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Then the chapters inform the readers regarding Third-generation sequencing (TGS) approachesas MinION sequencing and teaches use ofUbuntu Linux Virtual Machine configuration, clinical and environmental resistomes, use of FISH techniques and designing FISH probes, protocols for viral metagenomics, and comprehensive guideline for microbiome analysis usingmost used R packages. Written in the format of the highly successfulMethods in Molecular Biologyseries, each chapter includes an introduction to the topic, lists necessary materials and methods, includes tips on troubleshooting and known pitfalls, and step-by-step, readily reproducible protocols.Authoritative and cutting-edge,Metagenomic Data Analysis: Methods and Protocols aims to be comprehensive guide for researchers to specialize in the metagenomics field. 456 pp. Englisch.…

N° de réf. du vendeur 9781071630747

Titre
Metagenomic Data Analysis
Auteur
Suparna Mitra
Éditeur
Humana Jun 2023
Année de publication
2023
État de l'article
Neu
Reliure
Taschenbuch
Langue
anglais
ISBN à 10 chiffres
1071630741
ISBN à 13 chiffres
9781071630747
Poids de l'article
851 grammes
Dimensions
254x178x25 mm
Série
Livre 272 sur 382: Methods in Molecular Biology

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