Metagenomic Data Analysis

Langue : anglais

Edité par Springer, 2023

1071630717 / 9781071630716

Série : Livre 272 sur 382 - Methods in Molecular Biology

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Druck auf Anfrage Neuware - Printed after ordering - This volume describes different sequencing methods, pipelines and tools for metagenome data analyses. Chapters guide readers through quality control of raw sequence data, metagenomics databases for bacterial annotations suchGreengenes, SILVA, RDP and GTDB, guide to 16S rRNA microbiome analysis and pipelines such asmothur, DADA2,QIIME2, whole genome shotgun metagenomics data analyses pipeline using MEGAN and DIAMOND, web service such as PATRIC, RDP, mothur, Kaiju, PhyloPythiaS, MG-RAST, WebMGA, MicrobiomeAnalyst, WHAM!, METAGENassist and MGnify: EBI-Metagenomics, MG-RAST Metagenomics Analysis. Then the chapters inform the readers regarding Third-generation sequencing (TGS) approachesas MinION sequencing and teaches use ofUbuntu Linux Virtual Machine configuration, clinical and environmental resistomes, use of FISH techniques and designing FISH probes, protocols for viral metagenomics, and comprehensive guideline for microbiome analysis usingmost used R packages. Written in the format of the highly successfulMethods in Molecular Biologyseries, each chapter includes an introduction to the topic, lists necessary materials and methods, includes tips on troubleshooting and known pitfalls, and step-by-step, readily reproducible protocols.Authoritative and cutting-edge,Metagenomic Data Analysis: Methods and Protocols aims to be comprehensive guide for researchers to specialize in the metagenomics field.

N° de réf. du vendeur 9781071630716

Titre
Metagenomic Data Analysis
Auteur
Suparna Mitra
Éditeur
Springer
Année de publication
2023
État de l'article
Neu
Reliure
Buch
Langue
anglais
ISBN à 10 chiffres
1071630717
ISBN à 13 chiffres
9781071630716
Poids de l'article
1 048 grammes
Dimensions
260x183x30 mm
Série
Livre 272 sur 382: Methods in Molecular Biology

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