Modeling and Simulation of Protein Folding
Langue : anglais
Edité par Cuvillier, Cuvillier Jun 2011, 2011
- Livre broché
- Neuf
Vendeur : buchversandmimpf2000, Emtmannsberg, BAYE, Allemagnebuchversandmimpf2000
Vendeur AbeBooks depuis 23 janvier 2017
Etat: Neuf
EUR 34,44
Quantité disponible : 1 disponible
Ajouter au panierA propos de cet article
This item is printed on demand - Print on Demand Titel. Neuware -The book describes a new mathematical model for intracellular protein folding and the implementation of this model in the form of a novel simulation software. Besides, the related biological, chemical, and physical background, important for understanding and rationalization of the proposed model, is outlined, and a short overview of the best-known methods for protein structure prediction and molecular modeling is given. The first chapter provides a general introduction to the problem, characterizes the chemical structure of proteins, and summarizes amino acid properties, including chirality and ionization behavior. After that, the principles of quantum mechanics and their consequences for the molecular structure are described. The discussion goes over to covalent and hydrogen bonding, as well as to electrostatic and van der Waals interactions. Further, some known facts about the three-dimensional structure of proteins and typical conformations of amino acids are outlined, followed by a quick glance at the hydrophobic effect and the interaction of charged groups with the solvent. Later on the focus is shifted to biological aspects, starting with chaperons and assisted protein folding, mentioning prions, which put into question the popular hypothesis about the global energy minimum of any native structure, and continuing with details of protein synthesis in the cell, which constituted the basis for the proposed model. The chapter finishes with a short description of experimental methods for protein structure prediction and with some information about databases for storage of known protein structures. The second chapter starts with a short overview of the knowledge-based protein structure prediction and ab initio protein folding approaches, then continues with empirical molecular mechanics force fields, typically used for molecular modeling. After that, it describes computation of atomic partial charges with a focus on the procedure of J. Gasteiger and M. Marsili, and proceeds with some models for hydrogen bonding. The chapter ends with a discussion about implicit solvation models. The third chapter describes the new modeling approach and some mathematical theory developed in relation to it. The idea of the model is to simulate a process resembling intracellular cotranslational folding. An attachment of a new residue is performed in a way that the formed peptide group is disposed in the trans conformation, and only the chain twisting about certain single bonds is allowed. Transitions with an energy increase are permitted to a limited extent. Beside the electrostatic and van der Waals interactions, the proposed model incorporates hydrogen and disulfide bonding, solvation effects, and dielectric screening at the protein surface. A general expression connecting interatomic distances and dihedral angles is derived, which resulted in a formulation of the model in the space of molecular torsion angles. Twisting forces are computed analytically and utilized for the improvement of computational efficiency the folding simulations. Besides, equations for dynamics in the space of torsion angles are derived, and a conclusion related to folding pathways is drawn. The last chapter discusses some non-technical details related to the implementation of the proposed model, including a number of developed algorithms, and the resulting simulation software. The chapter ends with a short discussion of simulation results and with an outlook. This book is aimed in the first place to biophysicists and bioinformaticians, but can be also interesting for theoretical chemists, mathematicians, and molecular biologists, since it includes a broad interdisciplinary overview accompanied by unique visualizations, which were performed with the help of the simulation software developed by the author.Cuvillier Verlag, Nonnenstieg 8, 37075 Göttingen 218 pp. Englisch.…
N° de réf. du vendeur 9783869557984
- Titre
- Modeling and Simulation of Protein Folding
- Auteur
- Anna Shumilina
- Éditeur
- Cuvillier, Cuvillier Jun 2011
- Année de publication
- 2011
- État de l'article
- Neu
- Reliure
- Taschenbuch
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 3869557982
- ISBN à 13 chiffres
- 9783869557984
- Poids de l'article
- 289 grammes
- Dimensions
- 210x148x13 mm
« Synopsis » peut appartenir à une autre édition de cet ouvrage.
buchversandmimpf2000
Emtmannsberg, BAYE, Allemagne
Vendeur AbeBooks depuis 23 janvier 2017
Frais d'expédition de Allemagne vers Etats-Unis
| Article | 60 à 60 jours ouvrés | 60 à 60 jours ouvrés |
|---|---|---|
| Premier article | EUR 60,00 | EUR 75,00 |
Modes de paiement
- Chèque
- Paypal
Description de la boutique
Impressum Thorsten Retsch Buchversand Mimpf2000 Oberölschnitz 16 95517 Emtmannsberg Deutschland Telefon: 09209-2023188 Email: mimpf2000@online.de USt-ID-Nr.: DE 235096871 Wir führen gebrauchte Bücher aus allen Sparten der Literatur
Spécialité
Modernes Antiquariat - Bücher von 1960 bis heuteProfil professionnel du vendeur
buchversandmimpf2000
Allemagne
Conditions de vente
Impressum
Gesetzliche Anbieterkennung:
Thorsten Retsch
Buchversand Mimpf2000
Oberölschnitz 16
95517 Emtmannsberg
Deutschland
Telefon: 092092023188
E-Mail: order@buchversandmimpf2000.de
USt-IdNr.: DE 235096871
Alternative Streitbeilegung:
Die Europäische Kommission stellt eine Plattform für die außergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter http://ec.europa.eu/odr.
Droit de rétractation
Si vous êtes un consommateur, vous pouvez exercer votre droit de rétractation sur le contrat conformément à ce qui suit. Le mot « consommateur » désigne toute personne physique agissant à des fins qui n'entrent pas dans le cadre de son activité commerciale, artisanale ou professionnelle.
Informations concernant le droit de rétractation
Droit statutaire de rétractation
Vous avez le droit d'exercer votre droit de rétractation sur ce contrat dans les 14 jours sans donner de raison.
Le délai de rétractation expirera au bout de 14 jours à compter du jour où vous-même, ou un tiers autre que le transporteur et désigné par vous, prendrez physiquement possession de la dernière marchandise, du dernier lot ou de la dernière pièce.
Pour exercer votre droit de rétractation, remplissez électroniquement et envoyez une déclaration claire sur notre site Web, sous « Vos achats » dans « Votre compte ». Nous vous communiquerons sans délai un accusé de réception de cette rétractation sur un support durable (par exemple, par e-mail).
Pour respecter le délai de rétractation, il vous suffit d'envoyer votre message concernant l'exercice de votre droit de rétractation avant l'expiration du délai de rétractation.
Effets de la rétractation
Si vous exercez votre droit de rétractation sur ce contrat, nous vous rembourserons tous les paiements que vous avez effectués, y compris les frais de livraison (à l'exception des frais supplémentaires résultant du choix d'un mode de livraison autre que le type de livraison standard le moins cher que nous proposons).
Nous pouvons déduire du remboursement la perte de valeur de toute marchandise livrée, si la perte est le résultat d'une manipulation inutile de votre part.
Nous effectuerons le remboursement dans les meilleurs délais, et au plus tard 14 jours après le jour où nous aurons été informés de votre décision d'exercer votre droit de rétractation sur ce contrat.
Nous effectuerons le remboursement en utilisant le même moyen de paiement que celui que vous avez utilisé pour la transaction initiale, sauf si vous en avez expressément convenu autrement ; en tout état de cause, aucuns frais ne vous seront facturés à la suite d'un tel remboursement.
Nous pouvons suspendre le remboursement jusqu'à ce que nous ayons reçu les marchandises ou que vous ayez fourni la preuve que vous avez renvoyé les marchandises, en fonction de la première éventualité.
Vous devez renvoyer les marchandises ou les remettre à buchversandmimpf2000, Emtmannsberg, BAYE, Germany, +49 09209-2023188, sans retard injustifié et, en tout état de cause, au plus tard 14 jours à compter du jour où vous nous avez communiqué votre décision de rétractation du présent contrat. Le délai est respecté si vous renvoyez les marchandises avant l'expiration du délai de 14 jours. Vous devrez prendre en charge les frais directs du renvoi des marchandises. Vous n'êtes responsable que de toute diminution de valeur des marchandises résultant d'une manipulation autre que celle nécessaire pour établir la nature, les caractéristiques et le fonctionnement des marchandises.
Exceptions au droit de rétractation
Le droit de rétractation ne s'applique pas à ce qui suit :
- Distribution de journaux, de revues ou de magazines, à l'exception des contrats d'abonnement ; et
- Fourniture d'un contenu numérique qui n'est pas fourni sur un support matériel (par exemple, sur un CD ou un DVD) si vous avez accepté, lors de votre commande, que nous puissions commencer à le livrer et que vous ne puissiez pas exercer votre droit de rétractation une fois la livraison commencée.
Conditions d'expédition
Soweit in der Artikelbeschreibung keine andere Frist angegeben ist, erfolgt die Lieferung der Ware innerhalb von 3-5 Werktagen nach Vertragsschluss, bei Vorauszahlung erst nach Eingang des vollständigen Kaufpreises und der Versandkosten. Alle Preise inkl. MwSt.