Parasite Genomics
Langue : anglais
Edité par Springer US Jul 2021, 2021
- Livre relié
- Neuf

Vendeur : BuchWeltWeit Ludwig Meier e.K., Bergisch Gladbach, AllemagneBuchWeltWeit Ludwig Meier e.K.
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This item is printed on demand - it takes 3-4 days longer - Neuware -This detailed book provides a comprehensive series of innovative research techniques and methodologies applied to the parasite genomics research area, all applying different approaches to analyzing parasite genomes and furthering the study of genetic complexity and the mechanisms of regulation. Beginning with chapters on novel sequencing and the bioinformatics pipeline, the volume continues by exploring diagnostic approaches using genomic tools, host-parasite interactions, as well as the genomics of parasite-derived extracellular vesicles. Written for the highly successful Methods in Molecular Biology series, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.Authoritative and practical, Parasite Genomics: Methods and Protocols creates a detailed picture of genomic approaches for researchers seeking a better understanding of characterizing parasite nucleic acid content. 348 pp. Englisch.…
N° de réf. du vendeur 9781071616802
- Titre
- Parasite Genomics
- Auteur
- Javier Sotillo
- Éditeur
- Springer US Jul 2021
- Année de publication
- 2021
- État de l'article
- Neu
- Reliure
- Buch
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 1071616803
- ISBN à 13 chiffres
- 9781071616802
- Poids de l'article
- 852 grammes
- Dimensions
- 260x183x25 mm
Part I: Novel Sequencing and Bioinformatic Pipelines for the Study of Parasite Genomes
1. Nanopore Long Read DNA Sequencing of Protozoan Parasites: Hybrid Genome Assembly of Trypanosoma cruzi
Florencia Díaz-Viraqué, Gonzalo Greif, Luisa Berná, and Carlos Robello
2. Chromosomes Conformation Capture Coupled with Next Generation Sequencing (Hi-C) in Plasmodium falciparum
Mohit Gupta, Todd Lenz, and Karine G. Le Roch
3. Sequencing and Reconstructing Helminth Mitochondrial Fenomes Directly from Genomic Next-Generation Sequencing Data
Nikola Palevich and Paul Haydon Maclean
4. Automated Phylogenetic Analysis Using Best Reciprocal BLAST
Erin R. Butterfield, James C. Abbott, and Mark C. Field
Part II: Diagnostic Approaches Using Genomic Tools
5. An Illumina MiSeq-Based Amplicon Sequencing Method for the Detection of Mixed Parasite Infections Using the Blastocystis SSU rRNA Gene as an Example
Jenny G. Maloney, Nadja S. George, Aleksey Molokin, and Monica Santin
6. Giardia duodenalis: Detection by Quantitative Real-Time PCR and Molecular Diversity
Alejandro Dashti, Pamela C. Köster, and David Carmena
Part III: Host-Parasite Interactions: Deciphering Gene Function and Molecular Processes in Parasites
7. Conditional Gene Deletion in Mammalian and Mosquito Stages of Plasmodium berghei Using Dimerizable Cre Recombinase
Priyanka Fernandes, Manon Loubens, Olivier Silvie, and Sylvie Briquet
8. Coupling Auxin-Inducible Degron System with Ultrastructure Expansion Microscopy to Accelerate the Discovery of Gene Function in Toxoplasma gondii
Nicolas Dos Santos Pacheco and Dominique Soldati-Favre9. Genome-Wide Analysis of RNA-Protein Interactions in Plasmodium falciparum Using eCLIP-Seq
Thomas Hollin, Steven Abel, and Karine G. Le Roch
10. Transcriptional Analysis of Tightly Synchronized Plasmodium falciparum Intraerythrocytic Stages by RT-qPCR
Núria Casas-Vila, Anastasia K. Pickford, Harvie P. Portugaliza, Elisabet Tintó-Font, and Alfred Cortés
11. Analysis of the Interaction between Plasmodium falciparum-Infected Erythrocytes and Human Endothelial Cells Using a Laminar Flow System, Bioinformatic Tracking and Transcriptome Analysis
Yifan Wu, Philip Bouws, Stephan Lorenzen, Iris Bruchhaus, and Nahla Galal Metwally
12. Integration of Genomic and Transcriptomic Data to Elucidate Molecular Processes in Babesia divergens
Luis Miguel González, Elena Sevilla, Miguel Fernández-García, Alejandro Sánchez-Flores, and Estrella Montero
13. Integration of Functional Genomic, T
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