Quantitative Proteomik mit Datenbanken in Java | Protein-Protein-Interaktionsnetze in Aktion

Christoph Gernert

ISBN 10: 3639301234 / ISBN 13: 9783639301236

Edité par VDM Verlag Dr. Müller, 2010

A propos de cet article

Quantitative Proteomik mit Datenbanken in Java | Protein-Protein-Interaktionsnetze in Aktion | Christoph Gernert | Taschenbuch | Deutsch | VDM Verlag Dr. Müller | EAN 9783639301236 | Verantwortliche Person für die EU: VDM Verlag Dr. Müller, Brivibas Gatve 197, 1039 RIGA, LETTLAND, customerservice[at]vdm-vsg[dot]de | Anbieter: preigu.

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Détails bibliographiques

• Titre: Quantitative Proteomik mit Datenbanken in Java | Protein-Protein-Interaktionsnetze in Aktion
• Éditeur: VDM Verlag Dr. Müller
• Date de parution: 2010
• Langue: allemand
• ISBN à 10 chiffres: 3639301234
• ISBN à 13 chiffres: 9783639301236
• Reliure: Taschenbuch
• État de l'article: Neu
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Synopsis

In dieser Arbeit werden High-Throughput-Daten aus der Massenspektrometrie erfolgreich mit Methoden aus der Informatik, wie Protein-Protein- Interaktionsdatenbanken und Visualisierungstechniken verbunden, um unter anderem Unterschiede in gesundem und Krebsgewebe aufzuzeigen oder den Verlauf einer Zell-Stimulierung zeitlich aufgelöst darzustellen. Wichtige biologische und technische Grundlagen werden zu Beginn verständlich erklärt. Dabei wird auf die Werkzeuge der Proteomik, insbesondere auf die Massenspektrometrie, eingegangen. Das eingeführte System kann quantitative Proteomanalysen mittels iTRAQ? in Protein-Protein-Interaktionsnetzen darstellen. Diese Interaktionsnetze werden aus Informationen in aktuellen Publikationen generiert, die in einer relationalen Datenbank abgelegt sind, welche mittels Java an das System angebunden wird. Mögliche Signalwege in den Netzwerken werden aufgrund statistisch robuster Regulationsdaten aus der Massenspektrometrie mittels der "Divergence" berechnet. Die Divergence gibt darüber hinaus Aufschluss über die Mengenänderung und strukturelle Veränderungen eines Proteins.