Single Cell Transcriptomics
Langue : anglais
Edité par Humana Dez 2022, 2022
- Livre relié
- Neuf

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This item is printed on demand - Print on Demand Titel. Neuware -This volume provides up-to-date methods on single cell wet and bioinformatics protocols based on the researcher experiment requirements. Chapters detail basic analytical procedures, single-cell data QC, dimensionality reduction, clustering, cluster-specific features selection, RNA velocity, multi-modal data integration, and single cell RNA editing. Written in the highly successful Methods in Molecular Biology series format, chapters include introductions to their respective topics, lists of the necessary materials and reagents, step-by-step, readily reproducible laboratory protocols, and tips on troubleshooting and avoiding known pitfalls.Cutting-edge and comprehensive, Single Cell Transcriptomics: Methods and Protocols aims to be a valuable resource for all researchers interested in learning more about this important and developing field.Libri GmbH, Europaallee 1, 36244 Bad Hersfeld 404 pp. Englisch.
N° de réf. du vendeur 9781071627556
- Titre
- Single Cell Transcriptomics
- Auteur
- Raffaele A. Calogero
- Éditeur
- Humana Dez 2022
- Année de publication
- 2022
- État de l'article
- Neu
- Reliure
- Buch
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 1071627554
- ISBN à 13 chiffres
- 9781071627556
- Poids de l'article
- 954 grammes
- Dimensions
- 260x183x28 mm
- Série
- Livre 209 sur 382: Methods in Molecular Biology
1. Guidance on processing the 10x Genomics Single Cell Gene Expression Assay
Katharina Danielski
2. BD Rhapsody(TM) Single-Cell Analysis System Workflow: From sample to multimodal single cell sequencing dataJannes Ulbrich, Vadir Lopez-Salmeron, and Ian Gerrard
3. Profiling transcriptional heterogeneity with Seq-Well S3: A low-cost, portable, high-fidelity platform for massively-parallel single-cell RNA-seq
Riley S Drake, Martin Arreola Villanueva, Mike Vilme, Daniela D Russo, Andrew Navia, J. Christopher Love, and Alex K. Shalek4. A MATQ-seq based protocol for single-cell RNA-seq in bacteria
Christina Homberger, Antoine-Emmanuel Saliba, and Jörg Vogel
5. Full-length single-cell RNA-sequencing with FLASH-seq
Vincent Hahaut and Simone Picelli
6. Plant single cell/nucleus RNA-seq workflow
Sandra Thibivilliers, Andrew Farmer, Susan Schroeder, and Marc Libault
7. Ensuring Quality Cell Input for Single Cell Sequencing Experiments by Viability and Singlet Enrichment using Cell Sorting
Malte Paulsen
8. Tissue RNA integrity in Visium Spatial Protocol (Fresh Frozen Samples)
Federica Antico, Marta Gai, and Maddalena Arigoni
9. Single cell RNAseq data QC and preprocessing
Martina Olivero and Raffaele A Calogero
10. Single cell RNAseq complexity reductionFrancesca Cordero and Raffaele A Calogero
11. Functional-feature-based data reduction using sparsely connected autoencoders
Luca Alessandri and Raffaele A Calogero12. Single cell RNAseq clustering
Marco Beccuti and Raffaele A Calogero
13. Identifying Gene Markers Associated To Cell SubpopulationsMaria Luisa Ratto and Luca Alessandri
14. A guide to trajectory inference and RNA velocity
Philipp Weiler, Koen Van den Berge, Kelly Street, and Simone Tiberi
15. Integration of scATAC-seq with scRNA-seq data
Ivan Berest and Andrea Tangherloni
16. Using "Galaxy-rCASC", a public Galaxy instance for single-cell RNA-Seq data analysis
Pietro Mandreoli, Luca Alessandri, Raffaele A. Calogero, Marco Antonio Tangaro, Federico Zambelli17. Bringing cell subpopulation discovery on a cloud-HPC using rCASC and StreamFlow
Sandro G. Contaldo, Luca Alessandri, Iacopo Colonnelli, Marco Beccuti and Marco Aldinucci
18. Profiling RNA editing in single cells
Adriano Fonzino, Graziano Pesole, and Ernesto Picardi
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Alternative Streitbeilegung:
Die Europäische Kommission stellt eine Plattform für die außergerichtliche Online-Streitbeilegung (OS-Plattform) bereit, aufrufbar unter http://ec.europa.eu/odr.
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