Jean Hébrard a enseigné l’histoire en qualité de professeur associé à l'École des Hautes Études en Sciences sociales où il a codirigé jusqu’en 2023 le Centre de Recherches sur le Brésil Colonial et Contemporain (UMR Mondes américains) et y est aujourd’hui chercheur associé. Parallèlement, il a enseigné à l’Université du Michigan puis à Johns Hopkins University où il était professeur invité dans le département d’histoire. Il est aujourd’hui professeur-chercheur (Research Professor) dans le même département à JHU. Ses classes et séminaires portaient sur l'histoire sociale et culturelle des sociétés esclavagistes et post-esclavagistes du monde Atlantique. Il avait été auparavant chargé de recherche au Service d'histoire de l'éducation de l'Institut national de recherche pédagogique (unité de recherche associée au CNRS) où il travaillait sur les modes de transmission des savoirs élémentaires et sur les pratiques culturelles de l’écriture aux époques moderne et contemporaine. Dans ce cadre, il a notamment publié Discours sur la lecture (1880-2000), Paris, 2000 (en coll. avec Anne-Marie Chartier) et a participé aux grandes enquêtes sur l’histoire du livre et de la lecture en France (Histoire de l'édition française, Pratiques de la lecture, Le Grand Atlas des littératures, Histoire des bibliothèques françaises, etc.).
Depuis une vingtaine d’années, il a étendu ses recherches aux mondes coloniaux des empires catholiques de l’Atlantique. Il travaille actuellement sur la manière dont les esclaves et leurs descendants utilisent les cultures écrites des administrations coloniales pour conquérir des droits que leur statut juridique leur refuse et des identités, notamment onomastiques, dont ils ont été spoliés. Dans cette perspective, il a publié la première synthèse sur l’esclavage au Brésil (Brésil : quatre siècles d’esclavage, Paris, Karthala et CIRESC, 2012) et, en collaboration avec Rebecca J. Scott, Freedom Papers: An Atlantic Odyssey in the Age of Emancipation (Harvard University Press 2012) qui a reçu deux prix à l’American Historical Association et un à la Society for French Studies, et qui a été traduit en espagnol (Cuba et Colombie) et portugais (Brésil). Tous deux viennent de terminer une nouvelle version de Freedom Papers destinée au public francophone qui sera publiée en mai 2026 sous le titre De l’esclavage à la liberté. L’odyssée des Tinchant, 1793-1945 par les éditions Gallimard.