Bioinformatics with Python Cookbook
Langue : anglais
Edité par Packt Publishing Limited, GB, 2022
- Livre broché
- Neuf
Vendeur : Rarewaves.com USA, London, London, Royaume-UniRarewaves.com USA
Vendeur AbeBooks depuis 11 juin 2025
Etat: Neuf
EUR 73,51
Quantité disponible : Plus de 20 disponibles
Ajouter au panierA propos de cet article
Discover modern, next-generation sequencing libraries from the powerful Python ecosystem to perform cutting-edge research and analyze large amounts of biological dataKey FeaturesPerform complex bioinformatics analysis using the most essential Python libraries and applicationsImplement next-generation sequencing, metagenomics, automating analysis, population genetics, and much moreExplore various statistical and machine learning techniques for bioinformatics data analysisBook DescriptionBioinformatics is an active research field that uses a range of simple-to-advanced computations to extract valuable information from biological data, and this book will show you how to manage these tasks using Python.This updated third edition of the Bioinformatics with Python Cookbook begins with a quick overview of the various tools and libraries in the Python ecosystem that will help you convert, analyze, and visualize biological datasets. Next, you'll cover key techniques for next-generation sequencing, single-cell analysis, genomics, metagenomics, population genetics, phylogenetics, and proteomics with the help of real-world examples. You'll learn how to work with important pipeline systems, such as Galaxy servers and Snakemake, and understand the various modules in Python for functional and asynchronous programming. This book will also help you explore topics such as SNP discovery using statistical approaches under high-performance computing frameworks, including Dask and Spark. In addition to this, you'll explore the application of machine learning algorithms in bioinformatics.By the end of this bioinformatics Python book, you'll be equipped with the knowledge you need to implement the latest programming techniques and frameworks, empowering you to deal with bioinformatics data on every scale.What you will learnBecome well-versed with data processing libraries such as NumPy, pandas, arrow, and zarr in the context of bioinformatic analysisInteract with genomic databasesSolve real-world problems in the fields of population genetics, phylogenetics, and proteomicsBuild bioinformatics pipelines using a Galaxy server and SnakemakeWork with functools and itertools for functional programmingPerform parallel processing with Dask on biological dataExplore principal component analysis (PCA) techniques with scikit-learnWho this book is forThis book is for bioinformatics analysts, data scientists, computational biologists, researchers, and Python developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems. Working knowledge of the Python programming language is expected. Basic knowledge of biology will also be helpful.…
N° de réf. du vendeur LU-9781803236421
- Titre
- Bioinformatics with Python Cookbook
- Auteur
- Tiago Antao
- Éditeur
- Packt Publishing Limited, GB
- Année de publication
- 2022
- État de l'article
- New
- Reliure
- Paperback
- Langue
- anglais
- ISBN à 10 chiffres
- 1803236426
- ISBN à 13 chiffres
- 9781803236421
- Édition
- 3ème Édition
Discover modern, next-generation sequencing libraries from the powerful Python ecosystem to perform cutting-edge research and analyze large amounts of biological data
Key Features
- Perform complex bioinformatics analysis using the most essential Python libraries and applications
- Implement next-generation sequencing, metagenomics, automating analysis, population genetics, and much more
- Explore various statistical and machine learning techniques for bioinformatics data analysis
Book Description
Bioinformatics is an active research field that uses a range of simple-to-advanced computations to extract valuable information from biological data, and this book will show you how to manage these tasks using Python.
This updated edition of the Bioinformatics with Python Cookbook begins with a quick overview of the various tools and libraries in the Python ecosystem that will help you convert, analyze, and visualize biological datasets. As you advance through the chapters, you'll cover key techniques for next-generation sequencing, single-cell analysis, genomics, metagenomics, population genetics, phylogenetics, and proteomics with the help of real-world examples. You'll learn how to work with important pipeline systems, such as Galaxy servers and Snakemake, and understand the various modules in Python for functional and asynchronous programming. This book will also help you explore topics such as SNP discovery using statistical approaches under high-performance computing frameworks, including Dask and Spark, and the application of machine learning algorithms to bioinformatics.
By the end of this bioinformatics Python book, you'll be equipped with the knowledge to implement the latest programming techniques and frameworks, empowering you to deal with bioinformatics data on every kind of scale.
What you will learn
- Become well-versed with data processing libraries such as NumPy, pandas, arrow, and zarr in the context of bioinformatic analysis
- Interact with genomic databases
- Solve real-world problems in the fields of population genetics, phylogenetics, and proteomics
- Connect with the RCSB Protein Data Bank using GraphQL
- Build bioinformatics pipelines using a Galaxy server and Snakemake
- Work with functools and itertools for functional and asynchronous programming
- Perform parallel processing with Dask on biological data
- Explore PCA techniques with scikit-learn
Who This Book Is For
This book is for bioinformatics analysts, data scientists, computational biologists, researchers, and Python developers who want to address intermediate-to-advanced biological and bioinformatics problems. Working knowledge of the Python programming language is expected. Basic knowledge of biology would be helpful.
Table of Contents
- Python and the Surrounding Software Ecology
- Using Data Processing Libraries: numpy, pandas, arrow, and zarr
- Next Generation Sequencing
- Advanced NGS Data Processing
- Working with Genomes
- Population Genetics
- Phylogenetics
- Using the Protein Data Bank
- Bioinformatics Pipelines
- Functional and Asynchronous Programming
- Parallel Processing with Dask
- Machine Learning for Bioinformatics
« Synopsis » peut appartenir à une autre édition de cet ouvrage.
À propos de l’auteur
« A propos de ce titre » peut appartenir à une autre édition de cet ouvrage.
Rarewaves.com USA
London, London, Royaume-Uni
Vendeur AbeBooks depuis 11 juin 2025
Frais d'expédition de Royaume-Uni vers Etats-Unis
| Article | 10 à 15 jours ouvrés | 10 à 15 jours ouvrés |
|---|---|---|
| Premier article | EUR 0,00 | EUR 0,00 |
Modes de paiement
Profil professionnel du vendeur
RAREWAVES.COM LIMITED
Elsley Court, 20-22 Great Titchfield Street
London, Royaume-Uni W1W 8BE
Droit de rétractation
Si vous êtes un consommateur, vous pouvez exercer votre droit de rétractation sur le contrat conformément à ce qui suit. Le mot « consommateur » désigne toute personne physique agissant à des fins qui n'entrent pas dans le cadre de son activité commerciale, artisanale ou professionnelle.
Informations concernant le droit de rétractation
Droit statutaire de rétractation
Vous avez le droit d'exercer votre droit de rétractation sur ce contrat dans les 14 jours sans donner de raison.
Le délai de rétractation expirera au bout de 14 jours à compter du jour où vous-même, ou un tiers autre que le transporteur et désigné par vous, prendrez physiquement possession de la dernière marchandise, du dernier lot ou de la dernière pièce.
Pour exercer votre droit de rétractation, remplissez électroniquement et envoyez une déclaration claire sur notre site Web, sous « Vos achats » dans « Votre compte ». Nous vous communiquerons sans délai un accusé de réception de cette rétractation sur un support durable (par exemple, par e-mail).
Pour respecter le délai de rétractation, il vous suffit d'envoyer votre message concernant l'exercice de votre droit de rétractation avant l'expiration du délai de rétractation.
Effets de la rétractation
Si vous exercez votre droit de rétractation sur ce contrat, nous vous rembourserons tous les paiements que vous avez effectués, y compris les frais de livraison (à l'exception des frais supplémentaires résultant du choix d'un mode de livraison autre que le type de livraison standard le moins cher que nous proposons).
Nous pouvons déduire du remboursement la perte de valeur de toute marchandise livrée, si la perte est le résultat d'une manipulation inutile de votre part.
Nous effectuerons le remboursement dans les meilleurs délais, et au plus tard 14 jours après le jour où nous aurons été informés de votre décision d'exercer votre droit de rétractation sur ce contrat.
Nous effectuerons le remboursement en utilisant le même moyen de paiement que celui que vous avez utilisé pour la transaction initiale, sauf si vous en avez expressément convenu autrement ; en tout état de cause, aucuns frais ne vous seront facturés à la suite d'un tel remboursement.
Nous pouvons suspendre le remboursement jusqu'à ce que nous ayons reçu les marchandises ou que vous ayez fourni la preuve que vous avez renvoyé les marchandises, en fonction de la première éventualité.
Vous devez renvoyer les marchandises ou les remettre à Rarewaves.com USA, Unit 144 The Lightbox, 111 Power Road, W4 5PY, London, London, United Kingdom, sans retard injustifié et, en tout état de cause, au plus tard 14 jours à compter du jour où vous nous avez communiqué votre décision de rétractation du présent contrat. Le délai est respecté si vous renvoyez les marchandises avant l'expiration du délai de 14 jours. Vous devrez prendre en charge les frais directs du renvoi des marchandises. Vous n'êtes responsable que de toute diminution de valeur des marchandises résultant d'une manipulation autre que celle nécessaire pour établir la nature, les caractéristiques et le fonctionnement des marchandises.
Exceptions au droit de rétractation
Le droit de rétractation ne s'applique pas à ce qui suit :
- Distribution de journaux, de revues ou de magazines, à l'exception des contrats d'abonnement ; et
- Fourniture d'un contenu numérique qui n'est pas fourni sur un support matériel (par exemple, sur un CD ou un DVD) si vous avez accepté, lors de votre commande, que nous puissions commencer à le livrer et que vous ne puissiez pas exercer votre droit de rétractation une fois la livraison commencée.
Conditions d'expédition
Please note that we do not offer Priority shipping to any country.
We currently do not ship to the below countries:
Russia
Belarus
Ukraine
Please do not attempt to place orders with any of these countries as a ship to address - they will be cancelled.